La base documentaire de l'IFIP

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Publication Annéetrier par ordre croissant

Développement des outils de la sélection génomique

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L’IFIP coordonne et assure le suivi de projets de recherche sur le thème de la génomique, à l’interface entre les professionnels de la sélection regroupés au sein de BIOPORC et les organismes de recherche.

L’action est prioritairement conduite auprès des opérateurs responsables de la diffusion du progrès génétique, mais l’acquisition de nouvelles connaissances sur le génome de l’espèce porcine et le développement d’outils de sélection grâce à la génomique présentent un intérêt pour l’ensemble de la filière.
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2010

Deciphering the genetic control of innate and adaptive immune responses in pig: a combined genetic and genomic study

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Improving animal robustness and resistance to pathogens by adding health criteria in selection schemes is one of the challenging objectives of the next decade. In order to better understand the genetic control of immunity in French Large White pigs, we have launched a program combining genetic and genomic studies not focussing on any particular pathogen.
2010

Genetic variability, structure and assignment of Spanish and French pig populations based on a large sampling

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The Spanish and French pig populations share the common practice of quasi systematic paternity control of pure breed and composite line males. Ten microsatellite markers are in common between Spain and France controls, among the 17 markers used in France and the 13 used in Spain. After the adjustment of allele sizes, it is possible to merge the two datasets and to obtain a set of 5791 animals, including the vast majority of the males in the Duroc, Landrace, Large White and Piétrain French and Spanish breeds. Twelve French composite lines are also available.
2010

SwAn (Swine Anomalies) - Anomalies congénitales chez le porc : Cartographie fine des gènes sous-jacents. (2009-12)

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Les anomalies congénitales les plus courantes chez le porcelet sont les hernies (ombilicale, scrotale ou inguinale), la cryptorchidie, l’intersexualité. La fréquence d’animaux atteints est de 1 à 3% dans les populations commerciales porcines. En plus d’une perte économique directe, ces défauts ont un impact réel sur la santé et le bien-être des animaux. Certaines anomalies sont létales, d’autres nécessitent l’abattage des animaux. Pour toutes ces anomalies de nombreux arguments plaident en faveur d’un déterminisme génétique sous-jacent.
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2010

DéLiSus : variabilité haplotypique et phénotypage haut-débit chez le porc

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Le projet DéLiSus est un projet intégré ayant pour but l'étude de la variabilité haplotypique du génome porcin à haute densité (puce SNP 60k). Les principales races francaises, et les races synthétiques dérivées détenues par les sélectionneurs de BIOPORC sont étudiées. Les animaux des races principales sont phénotypés au sein de la station de contrôle du Rheu. Outre les paramètres zootechniques détaillés et une analyse metabolomique du sérum, une mesure de paramètres de la réponse immune est réalisée sur certains animaux.
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2010

A genetic and functional analysis of innate and adaptive immunity in pigs

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2010

Effects of 6 QTL regions on growth carcass composition and meat quality traits in 65 pig sire families

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PDF icon Effects of 6 QTL regions on growth carcass composition and meat quality traits in 65 pig sire families
2010

Genetic analysis of the immune response in pigs

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Resistance to disease and immunocompetence in livestock production is a complex issue. Introducing health criteria in the next generation selection schemes is one of the challenging objectives of the next decade. In this context, our aim is to study the genetic determinism of immune response in pig without focussing on a particular pathogen. A population of 443 60-day old castrated Large White males recorded for production traits in a testing farm unit was scored for various immunity parameters three weeks after vaccination against Mycoplasma Hyopneumoniae.
2010

Transcriptome épididymaire et testiculaire chez le verrat - Approche génomique et protéomique des mécanismes intervenant dans le contrôle de la fertilité du gamète mâle

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La qualité des spermatozoïdes (mobilité et les différentes étapes de reconnaissance ovocytaire) est liée à leur différenciation post-testiculaire lors de leur transit dans l’épididyme. La connaissance de la génomique fonctionnelle de cet organe et l'identification des facteurs contrôlant son activité sont primordiales pour comprendre les mécanismes d’acquisition de la fécondance des gamètes mâles.
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2009

Etude de la réponse immunitaire des porcs français de race Large White et analyse conjointe du transcriptome des leucocytes du sang périphérique

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Depuis plus de 25 ans maintenant, un programme de sélection génétique ciblant des caractères de production a été poursuivi en France dans l’espèce porcine. Associé à l’application de mesures sanitaires et médicales strictes, il a permis une nette amélioration des performances zootechniques des animaux. Cependant, la législation européenne, de plus en plus préoccupée par le bien-être animal et la sécurité du consommateur, a récemment interdit l’utilisation d’antibiotiques comme facteurs régulateurs de croissance et tend à réduire de manière générale les mesures prophylactiques médicamenteuses.
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2009

BIOMARK : Une évaluation minutieuse de plusieurs QTL en ségrégation dans les lignées commerciales françaises en vue de leur cartographie fine et de la mise en place d'une sélection assistée par marqueur

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Des très nombreux QTL ont été détectés influençant pratiquement tous les caractères pour lesquels des QTL ont été recherchés (Bidanel et Rothschild, 2002). La plupart du temps, ces études ont été réalisées sur des animaux F2 issus du croisement entre animaux de races différentes voire très différentes afin de maximiser la probabilité d’identifier de tels QTL. Pour les QTL les plus importants, il convient ensuite de les cartographier précisément afin de chercher à identifier le gène responsable des effets observés, et de pouvoir sélectionner les animaux porteurs des allèles favorables.
PDF icon BIOMARK : Une évaluation minutieuse de plusieurs QTL en ségrégation dans les lignées commerciales françaises en vue de leur cartographie fine et de la mise en place d'une sélection assistée par marqueur
2009

Projet CASDAR Acquisition des ressources humaines et des compétences en Génomique animale nécessaires au transfert des résultats du programme AGENAE (GENANIMAL) dans la pratique de l'amélioration génétique et de la gestion des populations concernées : Objectif et bilan du projet

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Le projet CASDAR « Génomique » (2005-2008) visait à doter l‘Institut de l’Elevage, l’IFIP, l’ITAVI et l’UNCEIA de ressources humaines compétentes en génomique. Des ingénieurs formés ont pu ainsi s’investir dans les instances de chaque filière (APIS-GENE, BIOPORC et AGENAVI) pour cogérer les programmes de recherche en génomique animale.
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2009

Mise en place d’un programme de sélection assistée par marqueurs dans la population sino-européenne Duochan.<br /><br />Implementation of a marker-assisted selection program in the Chinese-European Duochan pig population.

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Présentation du dispositif de sélection assistée par marqueurs (SAM) mis en place par l’OSP ADN depuis 2001 pour la sélection de verrats grand parentaux croisés chinois et premier bilan après 5 années de fonctionnement du programme de SAM.
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2009

Transcriptome épididymaire et testiculaire chez le verrat.<br /><br />The adult boar testicular and epididymal transcriptomes.

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Background
2009

Génétique moléculaire : quels nouveaux critères de sélection ?

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En France, la sélection raisonnée demeure, mais la prise en compte de données moléculaires va progressivement changer la donne.
2009

Mise en place d'un programme de sélection assistée par marqueurs dans la population sino-européenne Duochan

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Poster. Présentation du dispositif de sélection assistée par marqueurs (SAM) mis en place par l’OSP ADN depuis 2001 pour la sélection de verrats grand parentaux croisés chinois et premier bilan après 5 années de fonctionnement du programme de SAM.
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2009

Etude de la réponse immunitaire des porcs français de race Large White et analyse conjointe du transcriptome des leucocytes du sang périphérique

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L’espèce porcine a bénéficié depuis 20 ans d’un programme de sélection génétique qui a ciblé des caractères de production et cette sélection, accompagnée du respect de règles sanitaires strictes incluant vaccination et antibiothérapie préventive, a permis une nette amélioration des performances zootechniques. Or, dans une perspective de respect accru du bien-être animal et de la sécurité du consommateur, les normes européennes visent une réduction des mesures prophylactiques médicamenteuses.
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2008

Cartographie fine de QTL porcins : projet Biomark. BIOMARK : Une évaluation minutieuse de plusieurs QTL en ségrégation dans les lignées commerciales françaises en vue de leur cartographie fine et de la mise en place d'une sélection assistée par marqueur

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Des très nombreux QTL ont été détectés influençant pratiquement tous les caractères pour lesquels des QTL ont été recherchés (Bidanel et Rothschild, 2002). La plupart du temps, ces études ont été réalisées sur des animaux F2 issus du croisement entre animaux de races différentes voire très différentes afin de maximiser la probabilité d’identifier de tels QTL. Pour les QTL les plus importants, il convient ensuite de les cartographier précisément afin de chercher à identifier le gène responsable des effets observés, et de pouvoir sélectionner les animaux porteurs des allèles favorables.
PDF icon Cartographie fine de QTL porcins : projet Biomark. BIOMARK : Une évaluation minutieuse de plusieurs QTL en ségrégation dans les lignées commerciales françaises en vue de leur cartographie fine et de la mise en place d'une sélection assistée par marqueur
2008

Effects of six QTL regions on growth, carcass composition and meat quality traits in French commercial pig populations: first results of the BIOMARK project.<br /><br /><br /><br /><br />Estimation des effets de six QTL affectant les caractères de production dans des populations porcines commerciales : premiers résultats du projet BIOMARK.

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Poster. The effects of six QTL regions located on pig chromosomes 1 (two regions), 2, 4, 6 and 7 on 30 growth, carcass composition and meat quality traits were investigated in a set of 16 large (50 to 150 offspring) sire families issued from different French commercial populations. Sires and their progeny were genotyped for 2 or 3 microsatellite markers per QTL region (16 markers in total).
PDF icon Effects of six QTL regions on growth, carcass composition and meat quality traits in French commercial pig populations: first results of the BIOMARK project.<br /><br /><br /><br /><br />Estimation des effets de six QTL affectant les caractères de production dans des populations porcines commerciales : premiers résultats du projet BIOMARK.
2008

Transcriptome épididymaire et testiculaire chez le verrat. <br /><br />The adult boar testicular and epididymal transcriptome.

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Our laboratory has established the cartography of secreted proteins(secretomes) and proteins present (proteomes) in the epididymalfluid of different mammals and has demonstrated their regionalvariations along the epididymis. To extend the understanding of epididymal function in large mammals, we undertook a transcriptomic study of differentially expressed genes along the boar epididymis using the testis as organ of comparison. Our analysis focusedon genes considered to be markers of a single organ or a transcriptomic region and over-expressed mainly in this organ or region.
PDF icon Transcriptome épididymaire et testiculaire chez le verrat. <br /><br />The adult boar testicular and epididymal transcriptome.
2008

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