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Importance du phénotypage pour maintenir la précision des prédictions génomiques des caractères mesurés en station

Importance du phénotypage pour maintenir la précision des prédictions génomiques des caractères mesurés en station

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Auteurs : Carillier-Jacquin C, Bouquet A, Brenaut P, Simon C
Poster. L’évaluation génomique dans les lignées porcines maternelles françaises a été mise en place en 2016 et a permis d’augmenter le progrès génétique, notamment pour les caractères de reproduction. Cependant, des problèmes calculatoires sont apparus pour l’évaluation génomique de certains caractères de production mesurés en station, dont la capacité de phénotypage est limitée. Cela concerne particulièrement les candidats génotypés des élevages de sélection qui ne disposent pas de phénotypes en station et peu d’apparentés phénotypés. La structure de données pour ce type de caractère (i.e. porcs génotypés (candidats) non phénotypés et porcs phénotypés (animaux station) non génotypés) pourrait être responsable des problèmes de convergence observés pour la prédiction des valeurs génomiques. Dans cette étude, nous avons simulé, à partir de phénotypes réels mesurés sur l’ensemble des candidats à la sélection, différents scénarios pour mimer la situation de phénotypage partiel rencontrée dans le cas des caractères mesurés en station et évaluer l’impact d’une augmentation du nombre de porcs phénotypés sur la précision des valeurs génomiques obtenues.

Fiche technique

Titre :

Importance du phénotypage pour maintenir la précision des prédictions génomiques des caractères mesurés en station

Date sortie / parution :

2020

Référence :

52e Journée de la Recherche Porcine (FRA), 4 et 5 février 2020, Paris, p. 43-44, poster, 52e Journées de la Recherche Porcine (FRA), 4 et 5 février 2020, poster

Auteur

Pauline Photo Trombi Ifip

Ingénieur d’étude - Evaluation génomique des reproducteurs porcins

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