Refonte de la base nationale génétique Banapog
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Auteur :
Bazin C
Outil indispensable pour l’évaluation génétique et support d’études pour la recherche de nouveaux caractères à sélectionner, la base nationale génétique BANAPOG est le centre névralgique des données génétiques.Initiée en 2006, la base génétique a été mise en production en novembre 2010.Elle est hébergée au CTIG (Centre de Traitement de l’Information Génétique de l’INRA de Jouy en Josas) qui assure également le développement informatique. L’IFIP est responsable de la maîtrise d’œuvre du projet BANAPOG et de certaines applications périphériques impactées telles que les logiciels génétiques utilisés dans les élevages de sélection et de multiplication, les centres d’insémination artificielle et les stations de contrôle des performances. Il a fallu intégrer également la réforme de l’identification porcine de 2008 et assurer des passerelles entre l’ancien et le nouveau circuit de l’information génétique pour éviter des ruptures dans les travaux de routine d’évaluation génétique.L’objectif de la refonte était de permettre à l’ensemble des Organisations de Sélection Porcine, le stockage et la gestion des performances phénotypiques utiles à l’amélioration génétique des populations sélectionnées. Cette refonte a été accompagnée de la prise en compte de la nouvelle identification et l’utilisation d’un nouveau format d’échanges des données au format XML utilisés par tous les concepteurs.Les données brutes apportées des élevages sont transmises et stockées dans la base nationale génétique BANAPOG. Les données brutes valides et déduites et/ou ajustées sont ensuite extraites dans une base BDIR (Base de Données Indexation et Recherches) ne contenant que des données validées. Cette base sert de support aux équipes de recherche et d’indexation.La refonte intègre également des développements pour répondre aux nouveaux objectifs de la filière porcine et la possibilité de consultation et/ou de mise à jour de cette base avec des outils Internet.
Fiche technique
Titre :
Refonte de la base nationale génétique Banapog
Date sortie / parution :
2010
Référence :
Bilan d'action 2010 IFIP (Fiche n° 17) - Compétitivité des élevages et entreprises agro-alimentaires – Approches par la sélection génétique, p. 51