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Le transcriptome épididymaire du verrat: étude de la régionalisation

Le transcriptome épididymaire du verrat: étude de la régionalisation

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Auteurs : Guyonnet B, Dacheux JL, Jaffrézic F, Lacoste A, Marot G, Mercat MJ, Schwob S, Gatti JL
Chez les mammifères, les spermatozoïdes acquièrent leur pouvoir fécondant au cours du passage dans l’épididyme, organe constitué d'un tube pelotonné et relié au testicule par le canal efférent. L'épididyme est divisé en 3 régions morphologiques (tête, corps, queue) subdivisées en 10 zones.A l’aide d’une puce à ADN porcine (programme AGENAE, GEO : GPL3729), nous avons entrepris l’analyse du transcriptome épididymaire chez 4 verrats Large White adultes, sélectionnés sur leur qualité de reproducteur. Pour chaque animal, nous avons hybridé les ADNc dérivés d'ARN extraits du testicule, des canaux efférents et déférents et de 9 zones épididymaires. Les données obtenues ont été analysées selon deux méthodes statistiques non supervisées pour la recherche de classes : une méthode de partitionnement (PAM) et une méthode de classification hiérarchique (HCL). Seuls les gènes classés de la même manière par les deux types d’analyse ont été gardés pour les analyses fonctionnelles.Cette approche a démontré l’existence de 5 régions transcriptomiques au niveau épididymaire et de 3 classes de gènes ayant des expressions préférentielles au niveau de certaines de ces régions.

Fiche technique

Titre :

Le transcriptome épididymaire du verrat: étude de la régionalisation

Date sortie / parution :

2008

Référence :

40es Journées de la Recherche Porcine, Paris, 2008

Auteurs

Mercat2020

Ingénieure d’étude - Experte en génétique moléculaire et en génomique

Schwob

Ingénieure d’étude - Experte des évaluations génétiques porcines

Quelques mots clés

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