Modélisation de stratégies pour améliorer la sélection de l’efficacité alimentaire en cas d’interactions GxE

Posté présenté aux 54es JRP.
L’amélioration de l’efficacité alimentaire repose sur l’enregistrement de performances en élevages de sélection pour une fraction des candidats à la sélection. Ces animaux sont parents ou grands-parents des porcs croisés élevés dans les fermes de production. En présence d’interaction génétique x environnement (G x E) entre environnements de sélection et de production, cette stratégie est suboptimale : les meilleurs animaux en sélection ne sont alors pas toujours les meilleurs en production. Ces interactions sont typiquement quantifiées par l’estimation de corrélations génétiques entre caractères mesurés dans les deux environnements, une corrélation inférieure à 0,80 étant indicatrice d’interactions G x E pénalisant la réalisation des performances dans l’environnement non considéré pour la sélection (Mulder et Bijma, 2005). Ces corrélations génétiques pour l’efficacité alimentaire sont estimées entre 0,50 et 0,70 (Wientjes et Calus, 2017). Les causes de ces corrélations sont des effets environnementaux (alimentation, conditions d’ambiance, sanitaire…), et génétiques (races pures vs porcs croisés) différents entre sélection et production. Tusell et al. (2016) ont isolé la composante génétique en estimant ces corrélations entre des animaux de race pure et croisés élevés dans un même élevage, et ont trouvé des corrélations proches de 1 pour l’efficacité alimentaire, suggérant que l’essentiel des interactions rapportées par Wientjes et Calus (2017), pour ce caractère, correspond à des différences environnementales. Notre étude a pour objectif d’identifier les conditions de collecte de données complémentaires qui consolideraient les gains génétiques pour l’efficacité alimentaire dans un contexte de G x E.